Der Vorstand der Münchner Sportjugend hat im Sommer 2008 beschlossen, in Anlehnung an die Bayerische und Deutsche Sportjugend ein eigenes Juniorteam in München aufzubauen. Dabei handelte es sich um das erste Juniorteam auf Stadtebene im Sport.

Das MSJ-Juniorteam richtet sich an engagierte junge Sportlerinnen und Sportler aus Münchner Sportvereinen und möchte zur besseren Vernetzung, aber auch zur Festigung des ehrenamtlichen Engagements beitragen.