Der ehrenamtliche Vorstand (= Kreisjugendleitung) leitet die Münchner Sportjugend. Er setzt sich zusammen aus einem Vorsitzenden, einer zeichnungsberechtigten stellv. Vorsitzenden, der Jugendsprecherin sowie einem Jugendsprecher, sowie weiteren vier Stellvertreter*innen , denen bestimmte Aufgabenbereiche obliegen.
Satzungsgemäß gehört zudem die Schatzmeisterin des BLSV-Bezirks München-Stadt dem MSJ-Vorstand an.

Der Vorstand wird im Turnus von 4 Jahren von den Delegierten der Münchner Sportvereine und Fachverbände am Kreisjugendtag gewählt.
Vorsitzender und stellv. Vorsitzende sind darüber hinaus im Vorstand des BLSV-Bezirk München-Stadt vertreten.